细胞内新生RNA的变化是评价细胞活性的重要指标。EU (5-Ethynyl-Uridine) 是一种尿嘧啶核苷 类似物, 能够在细胞RNA转录时期代替尿嘧啶 (U) 掺入新合成的RNA分子中, 然后通过基于 EU 与荧光染料的特异性共轭反应,把荧光集团标记到新合成的含有 EU 的 RNA分子中,这样就可以 进行高效快速的荧光检测RNA的转录活性。本试剂盒将直接测定细胞内新生RNA的变化,病毒复制 等方面的研究。
传统的检测新生RNA的方法为以放射性同位素标记RNA等方法然后进行Southern blot进行检测。 但是这种方法需要放射性同位素标记及后续的复杂操作步骤。利用EU标记新生RNA的检测方法不需 要剧烈的RNA变性,只需温和的细胞固定化和透化处理,能够较好地保护细胞形态、RNA整体结构 及细胞内抗原识别位点,操作步骤更加快速、灵敏和准确,能在细胞和组织水平反映新生RNA转录 活性的状况。该试剂盒只需要简单的操作步骤,适用于荧光显微镜、共聚焦显微镜以及高内涵筛选 仪进行新生RNA的转录活性。
产品编号 | 试剂 | 浓度 | 试剂量 |
JX0906 | 细胞固定液 | 1× | 15 ml |
EU 溶液 | 1000× | 40 μl | |
反应缓冲液 | 10× | 1 ml | |
催化剂溶液 | 25× | 400 μl | |
TAMRA红色荧光溶液 | 400× | 25 μl | |
缓冲添加剂 | 粉末 | 200 mg | |
Hoechst 33342 | 1000× | 20 μl |
该试剂盒是采用成像检测方法对贴壁细胞进行检测,适用于荧光显微镜、共聚焦显微镜等仪器。 非贴壁细胞可在孵育EU后进行细胞涂片处理,固定后再采用贴壁细胞的染色流程进行检测。
1 、 盖玻片
2 、 1×PBS(pH7.2-7.6)(用DEPC水配置)
3 、 含0.5% Triton X-100的PBS (用DEPC水配置)
4 、 甘氨酸溶液(2 mg/ml)(用DEPC水配置)
5 、 培养板或培养皿
EU标记
(a) 将细胞完全培养基中按照500:1的比例加入EU溶液,制成2×EU标记培养基;
(b) 提前将2×EU标记培养基预热,然后等体积加入到细胞原有培养基中,获得1×EU溶液, 其中EU的终浓度为500 μM;
注:1)我们不建议替换全部培养基,因为这样可能会影响细胞增殖的速度;
2)配置好的培养基建议现用现配,用量以没过细胞为宜;
(c) 每孔加入300 μl含EU培养基孵育细胞2小时,弃培养基;
注:1) 培养时间取决于细胞的增殖速度和生长状态;
2) 孵育时间最少2小时,可延长至24小时后再检测也可以。
(d) 以1×PBS清洗细胞两次,每次5分钟,以除去未掺入RNA的EU残留。
注: 贴壁不牢的细胞可降低清洗强度。 细胞的固定和通透
(a) 每孔加入150 μl 细胞固定液,室温培养30分钟,弃固定液;
注: 1) 该试剂盒配备了细胞固定液,也可以使用含4%多聚甲醛的PBS来进行细胞固定;
2) 如果使用其他的细胞固定剂最好用DEPC水来配置,避免RNA酶降解细胞内的RNA。 (b) 每孔加入150 μl 2mg/ml 甘氨酸,摇床孵育5分钟;
(c) 弃甘氨酸溶液,每孔加入300 μl PBS洗液,室温清洗5分钟;
(d) 每孔加入300 μl 0.5% Triton X-100细胞通透液,室温通透10分钟,弃细胞通透溶液; (e) 每孔加入300 μl PBS洗液,室温清洗5分钟;
EU染色
(a) 通过用10:1去离子水稀释10×反应缓冲液进行配制1×EU 反应缓冲液;
(b) 按照溶解 200 mg缓冲添加剂溶于1ml去离子水的比例称取适量的粉末进行溶解,即为 可用的缓冲添加剂的浓度,建议现用现配;
注:缓冲添加剂为白色粉末,较难准确称量,称量范围可稍微放宽,但是不应超过±20% ,且该 粉末较易氧化,使用后请旋紧管盖,如试剂出现棕黄色,则需报废或更换。
(c) 按照以下的表格进行染色反应液的配制:
染色反应液组分 | 500 μl | 1 ml | 2 ml | 5 ml |
1×反应缓冲液 | 430 μl | 860 μl | 1.8 ml | 4.3 ml |
催化剂溶液 | 20 μl | 40 μl | 80 μl | 200 μl |
TAMRA红色荧光溶液 | 1.2 μl | 2.5 μl | 5 μl | 12.5 μl |
缓冲添加剂 | 50 μl | 100 μl | 200 μl | 500 μl |
(d) 每孔加入100 μl 配置好的检测混合液,以覆盖细胞为宜,避光、室温孵育30分钟; (e) 弃染色反应液,加入100 μl 0 .5% Triton X-100细胞渗透液清洗2-3次,每次10分钟; (f) 弃细胞渗透液,用PBS洗两次,每次5分钟。
DNA染色
(a) 将Hoechst 33342 用RNase-free 水溶液1: 1000 进行稀释得到终浓度为 1×Hoechst染色液;
(b) 每孔加入100 μl 1×Hoechst染色液,室温避光孵育20-30分钟后,弃染色液;
(c) 每孔加入100 μl PBS洗细胞两次,去掉洗液。
建议染色完成后立即进行荧光显微镜拍照观察;如果条件限制,请于4°C条件下避光湿润保存3
天之内完成拍照。若为细胞爬片或涂片,可使用抗荧光淬灭封片剂进行封片后于4°C条件下保存及拍 照检测。
荧光染料 |
最大激发波长 |
最大发射波长 |
荧光颜色 |
TAMRA |
541 nm |
567 nm |
橘红色荧光 |
Hoechst 33342 |
350 nm |
461 nm |
蓝色荧光 |

图注:将 J82 细胞分别不处理和用药物放线菌素 D(阴性对照药物)进行处理之后,通过该公司的 EU 新生 RNA 检测试剂盒检测正常细胞中显示非常强烈的 RNA 信号,而放线菌素 D 处理的细胞中 没有显著的信号。
